بر اساس مانگای یوشیو ساوای، بابوبو-بو بابوبو یکی از عجیب‌ترین و در عین حال خنده‌دارترین انیمه‌هاست که از بازی‌های زبانی، لباس پوشیدن متقاطع و شوخی‌های بصری زیادی استفاده می‌کند. این داستان در سال 300X اتفاق می‌افتد، جایی که یک سازمان شیطانی به نام امپراتوری کچل (امپراتوری مارگاریتا) در حال برنامه‌ریزی برای تسلط بر جهان با دزدیدن موهای همه است. امپراتوری کچل، به رهبری امپراتور کچل، باید از بابوبو-بو بابوبو عبور کند، که مصمم است به هر قیمتی جلوی آن‌ها را بگیرد. اما این کار آسان نخواهد بود، زیرا بابوبو-بو بابوبو آموزش دیده است تا "صدای موها را بشنود" و به او این امکان را می‌دهد که موهای بدن خود را برای انجام حرکات مختلف هنرهای رزمی به کار گیرد. در طول مسیر، او در نهایت به کمک دوستان عجیب و غریب خود نیاز خواهد داشت تا امپراتوری شیطانی کچل را شکست دهد.