10 سال از رویارویی کیرا و ال گذشته است. دوباره، شینیگامی دفترچه‌های مرگ را به زمین می‌فرستد و به خاطر این موضوع، جهان به زودی به هرج و مرج می‌افتد. تسوکورو عضو تیم ویژه دفترچه مرگ است که شامل 6 محقق دیگر از جمله ماتسودا می‌شود که تجربه پرونده کیرا را 10 سال پیش داشته است. قتل‌های جمعی ناشی از دفترچه مرگ در وال استریت در ایالات متحده، شیبویا در ژاپن و مکان‌های دیگر رخ می‌دهد. کارآگاه خصوصی مشهور جهانی، ریوزاکی، که جانشین قانونی ال است، نیز به تحقیق در مورد قتل‌های جمعی می‌پردازد. آن‌ها کشف می‌کنند که 6 دفترچه مرگ در جهان وجود دارد. ویروسی کامپیوتری به نام کیرا در جهان پخش می‌شود. پیامی در ویروس کیرا می‌گوید که 6 دفترچه مرگ را تحویل دهید. فردی که 6 دفترچه مرگ را دارد، بر جهان تسلط می‌یابد. رویارویی بین فردی که می‌خواهد کیرا را احیا کند و افرادی که می‌خواهند جلوی آن را بگیرند آغاز می‌شود.