داستان در سال 2027، یک سال پس از پایان چهارمین جنگ غیرهسته‌ای، اتفاق می‌افتد. شهر نیو پورت هنوز از عواقب جنگ رنج می‌برد که در اثر انفجار یک مین خودران بمب‌گذاری می‌شود. سپس، یک عضو نظامی که در رشوه‌خواری مربوط به فروش سلاح‌ها دخالت دارد، به ضرب گلوله کشته می‌شود. در طول تحقیقات، دایسکه آراماکی از بخش امنیت عمومی با موتوکو کوساناجی، سایبورگ و هکر سطح جادوگر که به واحد مخفی 501 ارتش منصوب شده، برخورد می‌کند. باتو، مردی با "چشمی که نمی‌خوابد"، مشکوک است که کوساناجی پشت این بمب‌گذاری باشد. کارآگاه توگوسا از پلیس استان نیهاما در حال پیگیری دو پرونده قتل، یکی مربوط به تیراندازی و دیگری قتل یک فاحشه است. خود موتوکو تحت نظر رئیس واحد مخفی 501، کورتسو و عوامل سایبورگ است.