داستان فیلم زمانی آغاز می‌شود که آراتا به‌طور تصادفی به "هرمس آپوکریفا"، گریمور لیلیت، دست می‌زند. ناگهان، او در نوری سفید و درخشان غرق می‌شود و دختری در برابر او ظاهر می‌شود. او خود را لیلیم معرفی می‌کند و آراتا و لیلیت را به‌عنوان والدینش می‌شناسد. همزمان با ظهور او، تغییراتی در جهان رخ می‌دهد. کتابخانه ممنوعه ابدی بیدار می‌شود. در این کتابخانه، اوج نهایی کیمیاگری، ارباب شیطانی سفید، مهر و موم شده است. ارباب شیطانی سفید نقشه می‌کشد تا آراتا و ترینیته هفت را از بین ببرد و جایگاه ارباب شیطانی را تصاحب کند. با قدرتی ناشناخته، ارباب شیطانی سفید به آراتا حمله می‌کند و بحرانی ناامیدکننده را به وجود می‌آورد که در آن آراتا و ترینیته هفت باید در این آخرین نبرد، جهان را نجات دهند.